Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CitP49025 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CitP49025 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CitP49025 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CitP49025 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CitP49025 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CitP49025 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CitP49025 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CitP49025 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CitP49025 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CitP49025 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CitP49025 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CitP49025 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CitP49025 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CitP49025 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CitP49025 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CitP49025 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CitP49025 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CitP49025 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CitP49025 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CitP49025 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CitP49025 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CitP49025 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CitP49025 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CitP49025 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CitP49025 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CitP49025 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CitP49025 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CitP49025 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CitP49025 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CitP49025 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CitP49025 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CitP49025 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CitP49025 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CitP49025 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CitP49025 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CitP49025 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CitP49025 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CitP49025 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CitP49025 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CitP49025 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CitP49025 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CitP49025 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CitP49025 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CitP49025 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CitP49025 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CitP49025 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CitP49025 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CitP49025 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CitP49025 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CitP49025 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CitP49025 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CitP49025 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CitP49025 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CitP49025 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CitP49025 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CitP49025 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CitP49025 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CitP49025 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CitP49025 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CitP49025 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CitP49025 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CitP49025 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CitP49025 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CitP49025 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CitP49025 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CitP49025 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CitP49025 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CitP49025 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CitP49025 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CitP49025 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CitP49025 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CitP49025 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CitP49025 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CitP49025 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CitP49025 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CitP49025 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CitP49025 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CitP49025 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CitP49025 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CitP49025 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CitP49025 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CitP49025 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CitP49025 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CitP49025 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CitP49025 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CitP49025 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CitP49025 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CitP49025 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CitP49025 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CitP49025 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CitP49025 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CitP49025 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CitP49025 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CitP49025 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CitP49025 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CitP49025 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CitP49025 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CitP49025 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CitP49025 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms