Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfx2P48379 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx2P48379 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfx2P48379 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfx2P48379 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfx2P48379 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfx2P48379 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfx2P48379 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfx2P48379 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rfx2P48379 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rfx2P48379 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx2P48379 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx2P48379 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx2P48379 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rfx2P48379 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rfx2P48379 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx2P48379 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx2P48379 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx2P48379 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx2P48379 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx2P48379 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx2P48379 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx2P48379 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx2P48379 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx2P48379 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfx2P48379 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx2P48379 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx2P48379 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx2P48379 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx2P48379 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx2P48379 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx2P48379 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx2P48379 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx2P48379 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx2P48379 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx2P48379 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx2P48379 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx2P48379 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms