Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 LPD1YFL018C 1500 nt8.19□□□□□ -1.1
DDI1P40087 RIM2YBR192W 1134 nt8.18□□□□□ -1.1
DDI1P40087 DAK2YFL053W 1776 nt8.17□□□□□ -1.1
DDI1P40087 SNX3YOR357C 489 nt8.17□□□□□ -1.1
DDI1P40087 LSM5YER146W 282 nt8.16□□□□□ -1.1
DDI1P40087 PRY1YJL079C 900 nt8.15□□□□□ -1.1
DDI1P40087 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.15□□□□□ -1.1
DDI1P40087 OYE2YHR179W 1203 nt8.14□□□□□ -1.11
DDI1P40087 YDR455CYDR455C 309 nt8.13□□□□□ -1.11
DDI1P40087 FIT1YDR534C 1587 nt8.13□□□□□ -1.11
DDI1P40087 RPT5YOR117W 1305 nt8.12□□□□□ -1.11
DDI1P40087 EAF3YPR023C 1206 nt8.12□□□□□ -1.11
DDI1P40087 LEU4YNL104C 1860 nt8.12□□□□□ -1.11
DDI1P40087 DPL1YDR294C 1770 nt8.12□□□□□ -1.11
DDI1P40087 SFL1YOR140W 2301 nt8.11□□□□□ -1.11
DDI1P40087 GND1YHR183W 1470 nt8.11□□□□□ -1.11
DDI1P40087 ERG13YML126C 1476 nt8.11□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 SMM1YNR015W 1155 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 MIM1YOL026C 342 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 FRA1YLL029W 2250 nt8.09□□□□□ -1.11
DDI1P40087 YDR467CYDR467C 327 nt8.07□□□□□ -1.12
DDI1P40087 HEM14YER014W 1620 nt8.07□□□□□ -1.12
DDI1P40087 TPS1YBR126C 1488 nt8.06□□□□□ -1.12
DDI1P40087 SAM3YPL274W 1764 nt8.06□□□□□ -1.12
DDI1P40087 RAD23YEL037C 1197 nt8.05□□□□□ -1.12
DDI1P40087 DDI1YER143W 1287 nt8.05□□□□□ -1.12
DDI1P40087 NPP2YEL016C 1482 nt8.04□□□□□ -1.12
DDI1P40087 SAC7YDR389W 1965 nt8.04□□□□□ -1.12
DDI1P40087 YMR265CYMR265C 1386 nt8.03□□□□□ -1.12
DDI1P40087 RPN14YGL004C 1254 nt8.03□□□□□ -1.12
DDI1P40087 YJL118WYJL118W 660 nt8.03□□□□□ -1.12
DDI1P40087 ELO1YJL196C 933 nt8.02□□□□□ -1.13
DDI1P40087 GLR1YPL091W 1452 nt8□□□□□ -1.13
DDI1P40087 HAP5YOR358W 729 nt8□□□□□ -1.13
DDI1P40087 RIB7YBR153W 735 nt8□□□□□ -1.13
DDI1P40087 FET5YFL041W 1869 nt8□□□□□ -1.13
DDI1P40087 HBS1YKR084C 1836 nt7.99□□□□□ -1.13
DDI1P40087 TMA23YMR269W 636 nt7.99□□□□□ -1.13
DDI1P40087 YNR064CYNR064C 873 nt7.99□□□□□ -1.13
DDI1P40087 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.98□□□□□ -1.13
DDI1P40087 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.98□□□□□ -1.13
DDI1P40087 RRT8YOL048C 1029 nt7.98□□□□□ -1.13
DDI1P40087 VRG4YGL225W 1014 nt7.97□□□□□ -1.13
DDI1P40087 LOT5YKL183W 921 nt7.97□□□□□ -1.13
DDI1P40087 MET30YIL046W 1923 nt7.96□□□□□ -1.13
DDI1P40087 RIB3YDR487C 627 nt7.96□□□□□ -1.14
DDI1P40087 YJL055WYJL055W 738 nt7.96□□□□□ -1.14
DDI1P40087 YLR111WYLR111W 333 nt7.96□□□□□ -1.14
DDI1P40087 KEL3YPL263C 1956 nt7.96□□□□□ -1.14
DDI1P40087 TRP2YER090W 1524 nt7.95□□□□□ -1.14
DDI1P40087 YJR114WYJR114W 393 nt7.95□□□□□ -1.14
DDI1P40087 YNL190WYNL190W 615 nt7.95□□□□□ -1.14
DDI1P40087 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.95□□□□□ -1.14
DDI1P40087 ADE8YDR408C 645 nt7.94□□□□□ -1.14
DDI1P40087 IMO32YGR031W 1029 nt7.94□□□□□ -1.14
DDI1P40087 NSG2YNL156C 900 nt7.94□□□□□ -1.14
DDI1P40087 YBL095WYBL095W 813 nt7.94□□□□□ -1.14
DDI1P40087 ORT1YOR130C 879 nt7.94□□□□□ -1.14
DDI1P40087 DUS3YLR401C 2007 nt7.93□□□□□ -1.14
DDI1P40087 SUV3YPL029W 2214 nt7.93□□□□□ -1.14
DDI1P40087 EMC3YKL207W 762 nt7.93□□□□□ -1.14
DDI1P40087 YMR244WYMR244W 1068 nt7.93□□□□□ -1.14
DDI1P40087 snR31snR31 225 nt7.93□□□□□ -1.14
DDI1P40087 THI6YPL214C 1623 nt7.92□□□□□ -1.14
DDI1P40087 GPM1YKL152C 744 nt7.92□□□□□ -1.14
DDI1P40087 YMC2YBR104W 990 nt7.92□□□□□ -1.14
DDI1P40087 DUR3YHL016C 2208 nt7.91□□□□□ -1.14
DDI1P40087 LAS17YOR181W 1902 nt7.9□□□□□ -1.14
DDI1P40087 AAT1YKL106W 1356 nt7.9□□□□□ -1.14
DDI1P40087 HXT11YOL156W 1704 nt7.89□□□□□ -1.15
DDI1P40087 HXT12YIL170W 1374 nt7.88□□□□□ -1.15
DDI1P40087 snR4snR4 186 nt7.88□□□□□ -1.15
DDI1P40087 GAL3YDR009W 1563 nt7.88□□□□□ -1.15
DDI1P40087 POP2YNR052C 1302 nt7.87□□□□□ -1.15
DDI1P40087 CRC1YOR100C 984 nt7.87□□□□□ -1.15
DDI1P40087 RTG2YGL252C 1767 nt7.85□□□□□ -1.15
DDI1P40087 OPI3YJR073C 621 nt7.85□□□□□ -1.15
DDI1P40087 CAB5YDR196C 726 nt7.84□□□□□ -1.15
DDI1P40087 YLR173WYLR173W 1827 nt7.82□□□□□ -1.16
DDI1P40087 YIL177CYIL177C 5277 nt7.82□□□□□ -1.16
DDI1P40087 ADE16YLR028C 1776 nt7.82□□□□□ -1.16
DDI1P40087 SRM1YGL097W 1449 nt7.82□□□□□ -1.16
DDI1P40087 RBG2YGR173W 1107 nt7.82□□□□□ -1.16
DDI1P40087 YMR226CYMR226C 804 nt7.82□□□□□ -1.16
DDI1P40087 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms