Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pola1P33609 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pola1P33609 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pola1P33609 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pola1P33609 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pola1P33609 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pola1P33609 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pola1P33609 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pola1P33609 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pola1P33609 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pola1P33609 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pola1P33609 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pola1P33609 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pola1P33609 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pola1P33609 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pola1P33609 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pola1P33609 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pola1P33609 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Pola1P33609 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pola1P33609 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pola1P33609 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pola1P33609 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pola1P33609 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pola1P33609 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pola1P33609 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pola1P33609 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Pola1P33609 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pola1P33609 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pola1P33609 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Pola1P33609 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pola1P33609 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Pola1P33609 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pola1P33609 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pola1P33609 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pola1P33609 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pola1P33609 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pola1P33609 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pola1P33609 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pola1P33609 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pola1P33609 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Pola1P33609 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pola1P33609 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pola1P33609 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pola1P33609 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pola1P33609 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pola1P33609 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pola1P33609 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pola1P33609 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pola1P33609 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pola1P33609 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Pola1P33609 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pola1P33609 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pola1P33609 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Pola1P33609 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Pola1P33609 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pola1P33609 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pola1P33609 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Pola1P33609 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Pola1P33609 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pola1P33609 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pola1P33609 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pola1P33609 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pola1P33609 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Pola1P33609 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Pola1P33609 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Pola1P33609 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Pola1P33609 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pola1P33609 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pola1P33609 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Pola1P33609 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pola1P33609 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pola1P33609 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pola1P33609 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pola1P33609 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pola1P33609 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pola1P33609 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pola1P33609 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pola1P33609 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pola1P33609 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pola1P33609 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pola1P33609 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pola1P33609 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pola1P33609 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pola1P33609 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Pola1P33609 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pola1P33609 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pola1P33609 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pola1P33609 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pola1P33609 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pola1P33609 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pola1P33609 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Pola1P33609 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pola1P33609 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Pola1P33609 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Pola1P33609 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pola1P33609 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pola1P33609 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pola1P33609 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pola1P33609 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pola1P33609 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms