Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HexaP29416 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HexaP29416 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HexaP29416 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HexaP29416 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HexaP29416 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HexaP29416 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HexaP29416 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HexaP29416 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HexaP29416 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HexaP29416 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HexaP29416 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HexaP29416 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HexaP29416 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HexaP29416 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HexaP29416 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HexaP29416 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HexaP29416 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HexaP29416 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HexaP29416 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HexaP29416 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HexaP29416 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HexaP29416 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HexaP29416 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HexaP29416 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HexaP29416 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HexaP29416 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HexaP29416 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HexaP29416 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HexaP29416 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HexaP29416 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HexaP29416 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HexaP29416 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HexaP29416 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HexaP29416 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HexaP29416 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HexaP29416 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HexaP29416 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HexaP29416 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HexaP29416 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HexaP29416 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HexaP29416 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HexaP29416 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HexaP29416 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HexaP29416 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HexaP29416 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HexaP29416 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HexaP29416 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HexaP29416 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HexaP29416 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HexaP29416 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HexaP29416 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HexaP29416 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HexaP29416 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HexaP29416 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HexaP29416 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HexaP29416 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HexaP29416 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HexaP29416 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HexaP29416 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HexaP29416 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HexaP29416 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HexaP29416 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HexaP29416 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HexaP29416 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HexaP29416 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HexaP29416 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HexaP29416 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HexaP29416 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HexaP29416 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HexaP29416 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HexaP29416 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HexaP29416 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HexaP29416 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HexaP29416 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HexaP29416 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HexaP29416 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HexaP29416 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HexaP29416 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HexaP29416 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HexaP29416 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HexaP29416 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HexaP29416 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HexaP29416 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HexaP29416 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HexaP29416 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HexaP29416 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HexaP29416 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HexaP29416 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HexaP29416 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HexaP29416 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HexaP29416 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HexaP29416 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HexaP29416 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HexaP29416 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HexaP29416 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HexaP29416 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HexaP29416 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HexaP29416 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HexaP29416 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms