Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pabpc1P29341 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpc1P29341 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpc1P29341 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpc1P29341 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc1P29341 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc1P29341 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pabpc1P29341 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pabpc1P29341 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pabpc1P29341 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc1P29341 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pabpc1P29341 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pabpc1P29341 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pabpc1P29341 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc1P29341 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc1P29341 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc1P29341 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc1P29341 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pabpc1P29341 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pabpc1P29341 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pabpc1P29341 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pabpc1P29341 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pabpc1P29341 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc1P29341 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc1P29341 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pabpc1P29341 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pabpc1P29341 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pabpc1P29341 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpc1P29341 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpc1P29341 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpc1P29341 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pabpc1P29341 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pabpc1P29341 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc1P29341 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpc1P29341 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc1P29341 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc1P29341 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc1P29341 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc1P29341 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc1P29341 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpc1P29341 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpc1P29341 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc1P29341 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc1P29341 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc1P29341 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpc1P29341 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc1P29341 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc1P29341 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms