Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd9P28357 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd9P28357 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd9P28357 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd9P28357 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd9P28357 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd9P28357 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd9P28357 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd9P28357 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd9P28357 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd9P28357 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd9P28357 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd9P28357 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd9P28357 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd9P28357 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd9P28357 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd9P28357 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd9P28357 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd9P28357 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd9P28357 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd9P28357 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd9P28357 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd9P28357 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd9P28357 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd9P28357 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd9P28357 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd9P28357 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms