Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NefhP19246 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NefhP19246 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NefhP19246 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NefhP19246 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NefhP19246 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NefhP19246 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NefhP19246 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NefhP19246 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NefhP19246 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NefhP19246 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NefhP19246 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NefhP19246 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NefhP19246 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NefhP19246 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NefhP19246 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NefhP19246 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NefhP19246 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NefhP19246 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NefhP19246 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NefhP19246 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NefhP19246 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NefhP19246 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NefhP19246 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NefhP19246 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NefhP19246 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NefhP19246 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NefhP19246 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NefhP19246 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NefhP19246 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NefhP19246 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NefhP19246 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NefhP19246 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NefhP19246 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NefhP19246 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NefhP19246 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NefhP19246 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NefhP19246 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NefhP19246 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NefhP19246 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NefhP19246 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NefhP19246 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NefhP19246 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NefhP19246 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NefhP19246 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NefhP19246 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NefhP19246 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NefhP19246 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NefhP19246 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NefhP19246 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NefhP19246 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NefhP19246 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NefhP19246 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NefhP19246 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NefhP19246 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NefhP19246 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NefhP19246 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NefhP19246 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NefhP19246 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NefhP19246 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NefhP19246 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NefhP19246 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NefhP19246 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NefhP19246 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NefhP19246 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NefhP19246 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NefhP19246 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NefhP19246 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NefhP19246 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NefhP19246 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NefhP19246 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NefhP19246 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NefhP19246 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NefhP19246 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NefhP19246 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NefhP19246 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NefhP19246 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NefhP19246 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NefhP19246 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NefhP19246 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NefhP19246 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NefhP19246 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefhP19246 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefhP19246 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefhP19246 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NefhP19246 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NefhP19246 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NefhP19246 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefhP19246 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NefhP19246 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NefhP19246 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NefhP19246 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NefhP19246 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NefhP19246 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NefhP19246 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefhP19246 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefhP19246 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefhP19246 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefhP19246 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NefhP19246 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms