Protein–RNA interactions for Protein: P13504

Il1r1, Interleukin-1 receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1r1P13504 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Il1r1P13504 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Il1r1P13504 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Il1r1P13504 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Il1r1P13504 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Il1r1P13504 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Il1r1P13504 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Il1r1P13504 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Il1r1P13504 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Il1r1P13504 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Il1r1P13504 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Il1r1P13504 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Il1r1P13504 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Il1r1P13504 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Il1r1P13504 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Il1r1P13504 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Il1r1P13504 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Il1r1P13504 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Il1r1P13504 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Il1r1P13504 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Il1r1P13504 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms