Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk1P11440 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk1P11440 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk1P11440 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk1P11440 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk1P11440 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk1P11440 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk1P11440 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk1P11440 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk1P11440 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk1P11440 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk1P11440 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk1P11440 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk1P11440 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk1P11440 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk1P11440 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk1P11440 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk1P11440 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk1P11440 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk1P11440 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk1P11440 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk1P11440 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk1P11440 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk1P11440 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk1P11440 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk1P11440 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk1P11440 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk1P11440 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk1P11440 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk1P11440 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk1P11440 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk1P11440 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk1P11440 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk1P11440 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk1P11440 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk1P11440 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk1P11440 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk1P11440 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk1P11440 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdk1P11440 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms