Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxb8P09632 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxb8P09632 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxb8P09632 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxb8P09632 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxb8P09632 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxb8P09632 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxb8P09632 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxb8P09632 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxb8P09632 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxb8P09632 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxb8P09632 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxb8P09632 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hoxb8P09632 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxb8P09632 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb8P09632 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxb8P09632 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxb8P09632 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxb8P09632 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxb8P09632 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxb8P09632 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxb8P09632 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxb8P09632 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxb8P09632 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxb8P09632 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hoxb8P09632 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxb8P09632 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxb8P09632 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxb8P09632 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxb8P09632 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxb8P09632 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxb8P09632 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxb8P09632 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxb8P09632 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxb8P09632 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxb8P09632 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxb8P09632 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hoxb8P09632 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxb8P09632 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxb8P09632 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxb8P09632 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxb8P09632 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxb8P09632 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxb8P09632 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxb8P09632 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxb8P09632 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxb8P09632 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxb8P09632 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxb8P09632 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxb8P09632 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxb8P09632 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms