Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxc8P09025 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxc8P09025 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxc8P09025 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxc8P09025 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc8P09025 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc8P09025 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxc8P09025 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxc8P09025 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxc8P09025 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc8P09025 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc8P09025 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc8P09025 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc8P09025 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc8P09025 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc8P09025 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc8P09025 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxc8P09025 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxc8P09025 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hoxc8P09025 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxc8P09025 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxc8P09025 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxc8P09025 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc8P09025 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc8P09025 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc8P09025 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc8P09025 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc8P09025 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxc8P09025 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxc8P09025 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxc8P09025 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc8P09025 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc8P09025 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc8P09025 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxc8P09025 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxc8P09025 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc8P09025 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc8P09025 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc8P09025 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc8P09025 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxc8P09025 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxc8P09025 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc8P09025 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxc8P09025 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxc8P09025 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxc8P09025 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc8P09025 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc8P09025 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc8P09025 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxc8P09025 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxc8P09025 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxc8P09025 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxc8P09025 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxc8P09025 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxc8P09025 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxc8P09025 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxc8P09025 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxc8P09025 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxc8P09025 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxc8P09025 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxc8P09025 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxc8P09025 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxc8P09025 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc8P09025 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc8P09025 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc8P09025 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxc8P09025 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxc8P09025 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxc8P09025 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxc8P09025 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxc8P09025 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc8P09025 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc8P09025 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxc8P09025 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxc8P09025 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxc8P09025 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxc8P09025 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxc8P09025 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxc8P09025 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxc8P09025 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxc8P09025 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxc8P09025 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxc8P09025 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxc8P09025 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms