Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Ab1P01921 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Ab1P01921 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Ab1P01921 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Ab1P01921 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Ab1P01921 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Ab1P01921 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Ab1P01921 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Ab1P01921 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Ab1P01921 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Ab1P01921 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Ab1P01921 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Ab1P01921 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Ab1P01921 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Ab1P01921 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Ab1P01921 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Ab1P01921 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-Ab1P01921 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-Ab1P01921 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Ab1P01921 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Ab1P01921 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms