Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01648 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
P01648 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
P01648 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
P01648 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
P01648 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
P01648 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
P01648 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
P01648 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
P01648 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
P01648 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
P01648 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P01648 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
P01648 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
P01648 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P01648 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P01648 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
P01648 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
P01648 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
P01648 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
P01648 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
P01648 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
P01648 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
P01648 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
P01648 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
P01648 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
P01648 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P01648 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P01648 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P01648 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P01648 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
P01648 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P01648 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
P01648 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
P01648 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
P01648 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
P01648 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
P01648 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
P01648 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
P01648 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
P01648 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
P01648 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
P01648 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
P01648 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
P01648 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P01648 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
P01648 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
P01648 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
P01648 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P01648 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P01648 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
P01648 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
P01648 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P01648 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P01648 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P01648 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
P01648 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
P01648 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
P01648 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
P01648 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
P01648 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
P01648 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
P01648 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
P01648 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
P01648 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
P01648 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
P01648 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
P01648 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P01648 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P01648 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P01648 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P01648 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
P01648 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
P01648 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
P01648 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
P01648 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
P01648 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
P01648 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
P01648 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
P01648 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
P01648 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
P01648 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
P01648 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P01648 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
P01648 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
P01648 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
P01648 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
P01648 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
P01648 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
P01648 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
P01648 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
P01648 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
P01648 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
P01648 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
P01648 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
P01648 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
P01648 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
P01648 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
P01648 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
P01648 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 764.7 ms