Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Parp2O88554 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Parp2O88554 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Parp2O88554 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Parp2O88554 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Parp2O88554 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Parp2O88554 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Parp2O88554 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Parp2O88554 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Parp2O88554 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Parp2O88554 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Parp2O88554 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Parp2O88554 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Parp2O88554 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Parp2O88554 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Parp2O88554 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Parp2O88554 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Parp2O88554 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Parp2O88554 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Parp2O88554 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Parp2O88554 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Parp2O88554 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Parp2O88554 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Parp2O88554 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Parp2O88554 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Parp2O88554 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Parp2O88554 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Parp2O88554 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Parp2O88554 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Parp2O88554 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Parp2O88554 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Parp2O88554 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Parp2O88554 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Parp2O88554 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Parp2O88554 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Parp2O88554 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Parp2O88554 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Parp2O88554 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Parp2O88554 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Parp2O88554 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Parp2O88554 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Parp2O88554 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Parp2O88554 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Parp2O88554 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Parp2O88554 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Parp2O88554 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Parp2O88554 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Parp2O88554 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Parp2O88554 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Parp2O88554 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Parp2O88554 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Parp2O88554 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Parp2O88554 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Parp2O88554 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Parp2O88554 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Parp2O88554 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Parp2O88554 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Parp2O88554 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Parp2O88554 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Parp2O88554 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Parp2O88554 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Parp2O88554 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Parp2O88554 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Parp2O88554 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Parp2O88554 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Parp2O88554 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Parp2O88554 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Parp2O88554 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Parp2O88554 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Parp2O88554 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Parp2O88554 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Parp2O88554 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Parp2O88554 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Parp2O88554 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Parp2O88554 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Parp2O88554 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Parp2O88554 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Parp2O88554 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Parp2O88554 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Parp2O88554 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Parp2O88554 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Parp2O88554 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Parp2O88554 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Parp2O88554 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Parp2O88554 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Parp2O88554 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Parp2O88554 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Parp2O88554 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Parp2O88554 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Parp2O88554 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Parp2O88554 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Parp2O88554 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Parp2O88554 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Parp2O88554 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Parp2O88554 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Parp2O88554 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Parp2O88554 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Parp2O88554 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Parp2O88554 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Parp2O88554 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms