Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZfrO88532 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZfrO88532 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZfrO88532 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZfrO88532 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZfrO88532 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZfrO88532 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZfrO88532 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZfrO88532 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZfrO88532 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZfrO88532 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZfrO88532 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZfrO88532 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZfrO88532 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZfrO88532 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZfrO88532 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZfrO88532 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZfrO88532 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZfrO88532 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZfrO88532 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZfrO88532 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZfrO88532 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZfrO88532 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZfrO88532 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZfrO88532 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZfrO88532 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZfrO88532 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZfrO88532 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZfrO88532 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZfrO88532 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZfrO88532 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZfrO88532 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZfrO88532 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZfrO88532 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZfrO88532 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZfrO88532 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZfrO88532 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZfrO88532 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZfrO88532 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZfrO88532 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms