Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap1O55125 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap1O55125 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap1O55125 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap1O55125 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap1O55125 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap1O55125 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap1O55125 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap1O55125 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap1O55125 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap1O55125 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap1O55125 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap1O55125 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap1O55125 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nipsnap1O55125 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap1O55125 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap1O55125 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap1O55125 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap1O55125 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms