Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 ANKMY1-213ENST00000418505 568 ntTSL 421.83■■□□□ 1.091e-8■■■■■ 38
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PRPF4O43172 ANKMY1-214ENST00000418708 945 ntTSL 319.37■□□□□ 0.691e-8■■■■■ 38
PRPF4O43172 ANKMY1-219ENST00000464991 1221 ntTSL 1 (best)18.99■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 38
PRPF4O43172 ANKMY1-222ENST00000484526 2969 ntTSL 217.68■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 38
PRPF4O43172 ANKMY1-212ENST00000411765 652 ntTSL 415.68■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 38
PRPF4O43172 ANKMY1-224ENST00000496300 1569 ntTSL 514.73□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 38
PRPF4O43172 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 38
PRPF4O43172 ANKMY1-216ENST00000443318 565 ntTSL 313.46□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 38
PRPF4O43172 ANKMY1-218ENST00000462004 582 ntTSL 413.37□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 38
PRPF4O43172 ANKMY1-215ENST00000441168 555 ntTSL 411.96□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 38
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PRPF4O43172 BAP1-209ENST00000490804 870 ntTSL 215.15■□□□□ 0.023e-11■■■■■ 37.8
PRPF4O43172 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.092e-8■■■■■ 37.8
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PRPF4O43172 KPTN-204ENST00000595484 638 ntTSL 316.28■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 37.8
PRPF4O43172 KPTN-207ENST00000600271 743 ntTSL 514.41□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 37.8
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PRPF4O43172 GALNS-204ENST00000562831 609 ntTSL 323.25■■□□□ 1.318e-11■■■■■ 37.7
PRPF4O43172 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.928e-11■■■■■ 37.7
PRPF4O43172 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.98e-11■■■■■ 37.7
PRPF4O43172 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.848e-11■■■■■ 37.7
PRPF4O43172 GALNS-207ENST00000565364 1075 ntTSL 1 (best)19.76■□□□□ 0.758e-11■■■■■ 37.7
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PRPF4O43172 GALNS-212ENST00000568613 1804 ntTSL 212.3□□□□□ -0.448e-11■■■■■ 37.7
PRPF4O43172 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.046e-22■■■■■ 37.6
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PRPF4O43172 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.537e-8■■■■■ 37.6
PRPF4O43172 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.597e-8■■■■■ 37.6
PRPF4O43172 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.744e-9■■■■■ 37.5
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PRPF4O43172 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.267e-8■■■■■ 37.5
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PRPF4O43172 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.641e-18■■■■■ 37.3
PRPF4O43172 MSH6-202ENST00000411819 548 ntTSL 421.26■□□□□ 0.991e-21■■■■■ 37.3
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PRPF4O43172 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.088e-7■■■■■ 37.1
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PRPF4O43172 FPGS-205ENST00000423577 677 ntTSL 515.52■□□□□ 0.088e-11■■■■■ 36.3
PRPF4O43172 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.028e-11■■■■■ 36.3
PRPF4O43172 FPGS-213ENST00000479147 816 ntTSL 515.06■□□□□ 08e-11■■■■■ 36.3
PRPF4O43172 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 36.3
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PRPF4O43172 FPGS-214ENST00000479375 690 ntTSL 513.08□□□□□ -0.328e-11■■■■■ 36.3
PRPF4O43172 RAP1GAP-205ENST00000374763 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.418e-11■■■■■ 36.3
PRPF4O43172 RAP1GAP-209ENST00000471600 3238 ntTSL 512.27□□□□□ -0.448e-11■■■■■ 36.3
PRPF4O43172 FAM98B-204ENST00000559431 305 ntTSL 511.34□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 36.3
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PRPF4O43172 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 36.3
PRPF4O43172 AC140504.1-201ENST00000568766 498 ntAPPRIS P1 TSL 222.39■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 36.2
PRPF4O43172 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 36.2
PRPF4O43172 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 36.2
PRPF4O43172 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 36.2
PRPF4O43172 MPV17L-203ENST00000564148 529 ntTSL 417.38■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 36.2
PRPF4O43172 AC140504.1-203ENST00000567442 476 ntTSL 215.99■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 36.2
PRPF4O43172 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.093e-9■■■■■ 36.2
PRPF4O43172 FAM193B-211ENST00000508298 479 ntTSL 517.78■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 36.2
PRPF4O43172 FAM193B-210ENST00000507587 825 ntTSL 217.15■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 36.2
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