Protein–RNA interactions for Protein: O35657

Neu1, Sialidase-1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu1O35657 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neu1O35657 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neu1O35657 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neu1O35657 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Neu1O35657 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neu1O35657 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neu1O35657 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neu1O35657 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neu1O35657 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neu1O35657 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neu1O35657 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neu1O35657 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neu1O35657 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neu1O35657 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neu1O35657 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neu1O35657 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neu1O35657 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neu1O35657 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neu1O35657 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Neu1O35657 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neu1O35657 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neu1O35657 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neu1O35657 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neu1O35657 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neu1O35657 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neu1O35657 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neu1O35657 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neu1O35657 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neu1O35657 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Neu1O35657 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neu1O35657 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Neu1O35657 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Neu1O35657 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Neu1O35657 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Neu1O35657 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Neu1O35657 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Neu1O35657 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Neu1O35657 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Neu1O35657 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Neu1O35657 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Neu1O35657 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Neu1O35657 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Neu1O35657 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Neu1O35657 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neu1O35657 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neu1O35657 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neu1O35657 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Neu1O35657 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neu1O35657 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Neu1O35657 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neu1O35657 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neu1O35657 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neu1O35657 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neu1O35657 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neu1O35657 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neu1O35657 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neu1O35657 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neu1O35657 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neu1O35657 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neu1O35657 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neu1O35657 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neu1O35657 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neu1O35657 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neu1O35657 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neu1O35657 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms