Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-M9O19442 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-M9O19442 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-M9O19442 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-M9O19442 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-M9O19442 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-M9O19442 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2-M9O19442 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2-M9O19442 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
H2-M9O19442 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2-M9O19442 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-M9O19442 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-M9O19442 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-M9O19442 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-M9O19442 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-M9O19442 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-M9O19442 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-M9O19442 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2-M9O19442 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-M9O19442 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-M9O19442 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-M9O19442 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-M9O19442 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-M9O19442 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-M9O19442 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-M9O19442 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-M9O19442 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-M9O19442 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-M9O19442 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-M9O19442 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms