Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Casq1O09165 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Casq1O09165 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Casq1O09165 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Casq1O09165 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Casq1O09165 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Casq1O09165 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Casq1O09165 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Casq1O09165 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Casq1O09165 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Casq1O09165 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Casq1O09165 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Casq1O09165 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Casq1O09165 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Casq1O09165 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Casq1O09165 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Casq1O09165 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Casq1O09165 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Casq1O09165 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Casq1O09165 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Casq1O09165 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Casq1O09165 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Casq1O09165 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Casq1O09165 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Casq1O09165 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Casq1O09165 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Casq1O09165 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Casq1O09165 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Casq1O09165 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Casq1O09165 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Casq1O09165 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Casq1O09165 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Casq1O09165 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Casq1O09165 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Casq1O09165 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Casq1O09165 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Casq1O09165 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Casq1O09165 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Casq1O09165 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Casq1O09165 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Casq1O09165 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Casq1O09165 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Casq1O09165 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Casq1O09165 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Casq1O09165 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Casq1O09165 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Casq1O09165 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Casq1O09165 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Casq1O09165 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Casq1O09165 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Casq1O09165 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Casq1O09165 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Casq1O09165 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Casq1O09165 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Casq1O09165 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Casq1O09165 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Casq1O09165 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Casq1O09165 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Casq1O09165 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Casq1O09165 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Casq1O09165 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Casq1O09165 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Casq1O09165 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Casq1O09165 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Casq1O09165 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Casq1O09165 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Casq1O09165 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Casq1O09165 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Casq1O09165 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Casq1O09165 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Casq1O09165 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Casq1O09165 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Casq1O09165 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Casq1O09165 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Casq1O09165 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Casq1O09165 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Casq1O09165 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Casq1O09165 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Casq1O09165 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Casq1O09165 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Casq1O09165 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Casq1O09165 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
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