Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq2O09161 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casq2O09161 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq2O09161 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq2O09161 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq2O09161 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casq2O09161 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq2O09161 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq2O09161 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq2O09161 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq2O09161 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casq2O09161 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casq2O09161 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casq2O09161 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casq2O09161 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casq2O09161 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Casq2O09161 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casq2O09161 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casq2O09161 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casq2O09161 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casq2O09161 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casq2O09161 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casq2O09161 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casq2O09161 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casq2O09161 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casq2O09161 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casq2O09161 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casq2O09161 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Casq2O09161 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casq2O09161 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casq2O09161 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casq2O09161 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casq2O09161 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casq2O09161 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casq2O09161 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casq2O09161 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Casq2O09161 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casq2O09161 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Casq2O09161 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casq2O09161 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq2O09161 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq2O09161 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq2O09161 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq2O09161 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq2O09161 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casq2O09161 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casq2O09161 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casq2O09161 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casq2O09161 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casq2O09161 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casq2O09161 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casq2O09161 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casq2O09161 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casq2O09161 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casq2O09161 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casq2O09161 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casq2O09161 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casq2O09161 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casq2O09161 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casq2O09161 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casq2O09161 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casq2O09161 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casq2O09161 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casq2O09161 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casq2O09161 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casq2O09161 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms