Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp35M0QWN7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp35M0QWN7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp35M0QWN7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp35M0QWN7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp35M0QWN7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp35M0QWN7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp35M0QWN7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp35M0QWN7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp35M0QWN7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp35M0QWN7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp35M0QWN7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp35M0QWN7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp35M0QWN7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp35M0QWN7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp35M0QWN7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp35M0QWN7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp35M0QWN7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp35M0QWN7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp35M0QWN7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp35M0QWN7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp35M0QWN7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp35M0QWN7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp35M0QWN7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp35M0QWN7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp35M0QWN7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp35M0QWN7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp35M0QWN7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp35M0QWN7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp35M0QWN7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp35M0QWN7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp35M0QWN7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp35M0QWN7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp35M0QWN7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp35M0QWN7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp35M0QWN7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp35M0QWN7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp35M0QWN7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp35M0QWN7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp35M0QWN7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp35M0QWN7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp35M0QWN7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp35M0QWN7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp35M0QWN7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp35M0QWN7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp35M0QWN7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp35M0QWN7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp35M0QWN7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp35M0QWN7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp35M0QWN7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp35M0QWN7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp35M0QWN7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp35M0QWN7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp35M0QWN7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
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