Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LctF8VPT3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LctF8VPT3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LctF8VPT3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LctF8VPT3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LctF8VPT3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LctF8VPT3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LctF8VPT3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LctF8VPT3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
LctF8VPT3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LctF8VPT3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LctF8VPT3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LctF8VPT3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LctF8VPT3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LctF8VPT3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LctF8VPT3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LctF8VPT3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LctF8VPT3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LctF8VPT3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LctF8VPT3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LctF8VPT3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LctF8VPT3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LctF8VPT3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LctF8VPT3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LctF8VPT3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LctF8VPT3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LctF8VPT3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LctF8VPT3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LctF8VPT3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LctF8VPT3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LctF8VPT3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LctF8VPT3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LctF8VPT3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LctF8VPT3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LctF8VPT3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LctF8VPT3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LctF8VPT3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LctF8VPT3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LctF8VPT3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LctF8VPT3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LctF8VPT3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LctF8VPT3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LctF8VPT3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LctF8VPT3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LctF8VPT3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LctF8VPT3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LctF8VPT3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LctF8VPT3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LctF8VPT3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LctF8VPT3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LctF8VPT3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LctF8VPT3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LctF8VPT3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LctF8VPT3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LctF8VPT3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LctF8VPT3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LctF8VPT3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LctF8VPT3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms