Protein–RNA interactions for Protein: F7D3W5

Gm45837, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45837F7D3W5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm45837F7D3W5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm45837F7D3W5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm45837F7D3W5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm45837F7D3W5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm45837F7D3W5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm45837F7D3W5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm45837F7D3W5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm45837F7D3W5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm45837F7D3W5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm45837F7D3W5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm45837F7D3W5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm45837F7D3W5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm45837F7D3W5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm45837F7D3W5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm45837F7D3W5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm45837F7D3W5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm45837F7D3W5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm45837F7D3W5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm45837F7D3W5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm45837F7D3W5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm45837F7D3W5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm45837F7D3W5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm45837F7D3W5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm45837F7D3W5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm45837F7D3W5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm45837F7D3W5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm45837F7D3W5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm45837F7D3W5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm45837F7D3W5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm45837F7D3W5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm45837F7D3W5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm45837F7D3W5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm45837F7D3W5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm45837F7D3W5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm45837F7D3W5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm45837F7D3W5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm45837F7D3W5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm45837F7D3W5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm45837F7D3W5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm45837F7D3W5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm45837F7D3W5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm45837F7D3W5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm45837F7D3W5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm45837F7D3W5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm45837F7D3W5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm45837F7D3W5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm45837F7D3W5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm45837F7D3W5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm45837F7D3W5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm45837F7D3W5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms