Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc171E9Q1U1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc171E9Q1U1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc171E9Q1U1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc171E9Q1U1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc171E9Q1U1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc171E9Q1U1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc171E9Q1U1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc171E9Q1U1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc171E9Q1U1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc171E9Q1U1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc171E9Q1U1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc171E9Q1U1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc171E9Q1U1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc171E9Q1U1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc171E9Q1U1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc171E9Q1U1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc171E9Q1U1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc171E9Q1U1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc171E9Q1U1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc171E9Q1U1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc171E9Q1U1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc171E9Q1U1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccdc171E9Q1U1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc171E9Q1U1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc171E9Q1U1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc171E9Q1U1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc171E9Q1U1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc171E9Q1U1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc171E9Q1U1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc171E9Q1U1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc171E9Q1U1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc171E9Q1U1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc171E9Q1U1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc171E9Q1U1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc171E9Q1U1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc171E9Q1U1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc171E9Q1U1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc171E9Q1U1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc171E9Q1U1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc171E9Q1U1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc171E9Q1U1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc171E9Q1U1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc171E9Q1U1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc171E9Q1U1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc171E9Q1U1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc171E9Q1U1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc171E9Q1U1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc171E9Q1U1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc171E9Q1U1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc171E9Q1U1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc171E9Q1U1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc171E9Q1U1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc171E9Q1U1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc171E9Q1U1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc171E9Q1U1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc171E9Q1U1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc171E9Q1U1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc171E9Q1U1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc171E9Q1U1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc171E9Q1U1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
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