Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm3002E9PW72 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm3002E9PW72 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm3002E9PW72 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm3002E9PW72 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm3002E9PW72 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm3002E9PW72 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm3002E9PW72 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm3002E9PW72 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm3002E9PW72 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm3002E9PW72 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm3002E9PW72 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm3002E9PW72 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm3002E9PW72 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm3002E9PW72 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm3002E9PW72 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm3002E9PW72 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm3002E9PW72 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm3002E9PW72 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm3002E9PW72 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm3002E9PW72 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm3002E9PW72 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm3002E9PW72 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm3002E9PW72 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm3002E9PW72 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm3002E9PW72 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm3002E9PW72 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm3002E9PW72 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3002E9PW72 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3002E9PW72 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gm3002E9PW72 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3002E9PW72 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3002E9PW72 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3002E9PW72 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3002E9PW72 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3002E9PW72 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms