Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd5D6MZJ6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd5D6MZJ6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd5D6MZJ6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd5D6MZJ6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd5D6MZJ6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd5D6MZJ6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd5D6MZJ6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd5D6MZJ6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd5D6MZJ6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd5D6MZJ6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd5D6MZJ6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd5D6MZJ6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd5D6MZJ6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd5D6MZJ6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd5D6MZJ6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd5D6MZJ6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd5D6MZJ6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd5D6MZJ6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd5D6MZJ6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd5D6MZJ6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smpd5D6MZJ6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd5D6MZJ6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd5D6MZJ6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd5D6MZJ6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpd5D6MZJ6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpd5D6MZJ6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpd5D6MZJ6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd5D6MZJ6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd5D6MZJ6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd5D6MZJ6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd5D6MZJ6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd5D6MZJ6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd5D6MZJ6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd5D6MZJ6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd5D6MZJ6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd5D6MZJ6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd5D6MZJ6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Smpd5D6MZJ6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd5D6MZJ6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd5D6MZJ6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd5D6MZJ6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd5D6MZJ6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd5D6MZJ6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd5D6MZJ6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd5D6MZJ6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd5D6MZJ6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd5D6MZJ6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd5D6MZJ6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd5D6MZJ6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd5D6MZJ6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd5D6MZJ6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd5D6MZJ6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd5D6MZJ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpd5D6MZJ6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd5D6MZJ6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd5D6MZJ6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms