Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SafbD3YXK2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SafbD3YXK2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SafbD3YXK2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SafbD3YXK2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SafbD3YXK2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SafbD3YXK2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SafbD3YXK2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SafbD3YXK2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SafbD3YXK2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SafbD3YXK2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SafbD3YXK2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SafbD3YXK2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SafbD3YXK2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SafbD3YXK2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SafbD3YXK2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SafbD3YXK2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SafbD3YXK2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SafbD3YXK2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SafbD3YXK2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SafbD3YXK2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SafbD3YXK2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SafbD3YXK2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SafbD3YXK2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SafbD3YXK2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SafbD3YXK2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SafbD3YXK2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SafbD3YXK2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SafbD3YXK2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SafbD3YXK2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SafbD3YXK2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SafbD3YXK2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SafbD3YXK2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SafbD3YXK2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SafbD3YXK2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SafbD3YXK2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SafbD3YXK2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SafbD3YXK2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SafbD3YXK2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SafbD3YXK2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SafbD3YXK2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SafbD3YXK2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SafbD3YXK2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SafbD3YXK2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SafbD3YXK2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SafbD3YXK2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SafbD3YXK2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SafbD3YXK2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SafbD3YXK2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SafbD3YXK2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SafbD3YXK2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SafbD3YXK2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SafbD3YXK2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SafbD3YXK2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SafbD3YXK2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SafbD3YXK2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SafbD3YXK2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SafbD3YXK2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SafbD3YXK2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SafbD3YXK2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SafbD3YXK2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SafbD3YXK2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SafbD3YXK2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SafbD3YXK2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SafbD3YXK2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SafbD3YXK2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms