Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Rtf1A2AQ19 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rtf1A2AQ19 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rtf1A2AQ19 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rtf1A2AQ19 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rtf1A2AQ19 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rtf1A2AQ19 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rtf1A2AQ19 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rtf1A2AQ19 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rtf1A2AQ19 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Rtf1A2AQ19 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rtf1A2AQ19 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rtf1A2AQ19 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rtf1A2AQ19 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rtf1A2AQ19 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rtf1A2AQ19 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rtf1A2AQ19 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rtf1A2AQ19 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rtf1A2AQ19 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rtf1A2AQ19 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rtf1A2AQ19 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rtf1A2AQ19 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rtf1A2AQ19 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rtf1A2AQ19 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rtf1A2AQ19 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rtf1A2AQ19 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rtf1A2AQ19 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rtf1A2AQ19 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rtf1A2AQ19 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rtf1A2AQ19 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rtf1A2AQ19 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rtf1A2AQ19 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rtf1A2AQ19 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rtf1A2AQ19 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rtf1A2AQ19 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Rtf1A2AQ19 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rtf1A2AQ19 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rtf1A2AQ19 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rtf1A2AQ19 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rtf1A2AQ19 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rtf1A2AQ19 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rtf1A2AQ19 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rtf1A2AQ19 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Rtf1A2AQ19 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rtf1A2AQ19 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Rtf1A2AQ19 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rtf1A2AQ19 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rtf1A2AQ19 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rtf1A2AQ19 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rtf1A2AQ19 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rtf1A2AQ19 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rtf1A2AQ19 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rtf1A2AQ19 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rtf1A2AQ19 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rtf1A2AQ19 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rtf1A2AQ19 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rtf1A2AQ19 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rtf1A2AQ19 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rtf1A2AQ19 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Rtf1A2AQ19 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rtf1A2AQ19 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rtf1A2AQ19 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rtf1A2AQ19 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rtf1A2AQ19 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rtf1A2AQ19 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Rtf1A2AQ19 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rtf1A2AQ19 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rtf1A2AQ19 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rtf1A2AQ19 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rtf1A2AQ19 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms