Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ckap5A2AGT5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ckap5A2AGT5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ckap5A2AGT5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ckap5A2AGT5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap5A2AGT5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap5A2AGT5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap5A2AGT5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap5A2AGT5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ckap5A2AGT5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ckap5A2AGT5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ckap5A2AGT5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap5A2AGT5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap5A2AGT5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap5A2AGT5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap5A2AGT5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap5A2AGT5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap5A2AGT5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap5A2AGT5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap5A2AGT5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap5A2AGT5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap5A2AGT5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap5A2AGT5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ckap5A2AGT5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ckap5A2AGT5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ckap5A2AGT5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms