Protein–RNA interactions for Protein: A2ABG4

Tbc1d16, TBC1 domain family, member 16, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d16A2ABG4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tbc1d16A2ABG4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d16A2ABG4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d16A2ABG4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d16A2ABG4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d16A2ABG4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d16A2ABG4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d16A2ABG4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d16A2ABG4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d16A2ABG4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d16A2ABG4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d16A2ABG4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d16A2ABG4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d16A2ABG4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d16A2ABG4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d16A2ABG4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d16A2ABG4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d16A2ABG4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d16A2ABG4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d16A2ABG4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d16A2ABG4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d16A2ABG4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d16A2ABG4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d16A2ABG4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d16A2ABG4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d16A2ABG4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d16A2ABG4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d16A2ABG4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d16A2ABG4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d16A2ABG4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d16A2ABG4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d16A2ABG4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d16A2ABG4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d16A2ABG4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d16A2ABG4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d16A2ABG4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d16A2ABG4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d16A2ABG4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tbc1d16A2ABG4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d16A2ABG4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d16A2ABG4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d16A2ABG4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d16A2ABG4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d16A2ABG4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d16A2ABG4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d16A2ABG4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d16A2ABG4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d16A2ABG4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d16A2ABG4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d16A2ABG4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d16A2ABG4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d16A2ABG4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d16A2ABG4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 785.6 ms