Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp1bA1Z198 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp1bA1Z198 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp1bA1Z198 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp1bA1Z198 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp1bA1Z198 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp1bA1Z198 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp1bA1Z198 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp1bA1Z198 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp1bA1Z198 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp1bA1Z198 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp1bA1Z198 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp1bA1Z198 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp1bA1Z198 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp1bA1Z198 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp1bA1Z198 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp1bA1Z198 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp1bA1Z198 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp1bA1Z198 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp1bA1Z198 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp1bA1Z198 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp1bA1Z198 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp1bA1Z198 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp1bA1Z198 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp1bA1Z198 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp1bA1Z198 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp1bA1Z198 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp1bA1Z198 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp1bA1Z198 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp1bA1Z198 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp1bA1Z198 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp1bA1Z198 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp1bA1Z198 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp1bA1Z198 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp1bA1Z198 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp1bA1Z198 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms