Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTR2

0610012G03Rik, RIKEN cDNA 0610012G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
0610012G03RikA0A0J9YTR2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
0610012G03RikA0A0J9YTR2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
0610012G03RikA0A0J9YTR2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
0610012G03RikA0A0J9YTR2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
0610012G03RikA0A0J9YTR2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
0610012G03RikA0A0J9YTR2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
0610012G03RikA0A0J9YTR2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
0610012G03RikA0A0J9YTR2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
0610012G03RikA0A0J9YTR2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
0610012G03RikA0A0J9YTR2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms