Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY38

Ighv1-42, Immunoglobulin heavy variable V1-42 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-42A0A0A6YY38 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ighv1-42A0A0A6YY38 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ighv1-42A0A0A6YY38 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ighv1-42A0A0A6YY38 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighv1-42A0A0A6YY38 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighv1-42A0A0A6YY38 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighv1-42A0A0A6YY38 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighv1-42A0A0A6YY38 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv1-42A0A0A6YY38 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighv1-42A0A0A6YY38 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ighv1-42A0A0A6YY38 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighv1-42A0A0A6YY38 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighv1-42A0A0A6YY38 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighv1-42A0A0A6YY38 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighv1-42A0A0A6YY38 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighv1-42A0A0A6YY38 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighv1-42A0A0A6YY38 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighv1-42A0A0A6YY38 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ighv1-42A0A0A6YY38 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv1-42A0A0A6YY38 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv1-42A0A0A6YY38 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighv1-42A0A0A6YY38 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighv1-42A0A0A6YY38 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighv1-42A0A0A6YY38 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighv1-42A0A0A6YY38 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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