Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28171A0A087WQ19 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms