Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vamp5Q9Z2P8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms