Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C5Q9Y5Q8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C5Q9Y5Q8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms