Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms