Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms