Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms