Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MED13Q9UHV7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MED13Q9UHV7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MED13Q9UHV7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MED13Q9UHV7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MED13Q9UHV7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MED13Q9UHV7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MED13Q9UHV7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MED13Q9UHV7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MED13Q9UHV7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MED13Q9UHV7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms