Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms