Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms