Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPASTQ9UBP0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms