Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNMT3BQ9UBC3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms