Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms