Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms