Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM9Q9NXL9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms