Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE4

CCDC87, Coiled-coil domain-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC87Q9NVE4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC87Q9NVE4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC87Q9NVE4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms